Veidlapa Nr. M-3 (8)
Studiju kursa apraksts
DNS in vitro
Kursa kods
BUMK_004
Zinātnes nozare
Bioloģija; Ģenētika; Medicīniskā biotehnoloģija; Vides biotehnoloģija
Kredītpunkti (ECTS)
3,00
Mērķauditorija
Zobārstniecība
LKI
7. līmenis
Studiju veids un forma
Pilna laika
Studiju kursa īstenotājs
Kursa vadītājs
Agnese Zariņa
Struktūrvienības vadītājs
Juta Kroiča
Struktūrvienība
Bioloģijas un mikrobioloģijas katedra
Kontaktinformācija
Rīga, Dzirciema iela 16, bmk@rsu.lv, +371 67061584
Par studiju kursu
Mērķis
Veicināt zināšanu apguvi par mūsdienīgām DNS analīžu izmantošanas iespējām klīniskajā praksē.
Priekšzināšanas
Bioloģijā un ķīmijā (vidusskolas līmenī), pamatzināšanas molekulārajā bioloģijā.
Studiju rezultāti
Zināšanas
1.Studiju kursa apguves rezultātā studenti spēs raksturot ģenētiskās patoloģijas diagnostikas iespējas, izmantojot DNS analīzi.
Prasmes
1.Pratīs izdalīt DNS no dzīvām šūnām, varēs veikt mutāciju analīzi, izmantojot elektroforēzi. Spēs izmantot DNS analīzes metodes skrīninga programmu izstrādāšanai.
Kompetences
1.Studējošie, apvienojot teorētiskās zināšanas par ģenētiskās patoloģijas diagnostikas metodēm ar praktiskām iemaņām šo metožu izmantošanā, spēs novērtēt DNS diagnostikas nepieciešamību klīniskajā praksē.
Vērtēšana
Patstāvīgais darbs
|
Virsraksts
|
% no gala vērtējuma
|
Vērtējums
|
|---|---|---|
|
1.
Patstāvīgais darbs |
-
|
-
|
|
Studiju kursa ietvaros tiek organizēts individuālais darbs ar jaunāko zinātnisko literatūru un literatūras apskata par konkrētu tematu iesniegšana kursa beigās. Pastāvīgais darbs sastāda 50% no gala vērtējuma.
|
||
Pārbaudījums
|
Virsraksts
|
% no gala vērtējuma
|
Vērtējums
|
|---|---|---|
|
1.
Pārbaudījums |
-
|
-
|
|
Tiks reģistrēta praktisko nodarbību apmeklēšana, kontrolēta laboratorijas protokolu izpildīšana, veikta iegūto iemaņu pārbaude. Kursa beigās ir iespējams iegūt kumulatīvo vērtējumu, ko veido aktivitātes praktiskajās nodarbībās un patstāvīgie darbi.
|
||
Studiju kursa tēmu plāns
PILNA LAIKA
1. daļa
-
Nodarbība/Seminārs
|
Modalitāte
|
Norises vieta
|
Kontaktstundas
|
|---|---|---|
|
Klātiene
|
Auditorija
|
2
|
Tēmas
|
Horizontālās un vertikālās elektroforēzes pamatprincipi. PĶR produktu analīze agarozes gēlā. Restrikcijas fragmentu garuma polimorfisma analīze (RFLP).
|
-
Nodarbība/Seminārs
|
Modalitāte
|
Norises vieta
|
Kontaktstundas
|
|---|---|---|
|
Klātiene
|
Auditorija
|
2
|
Tēmas
|
Poliakrilamīda gēla elektroforēze (PAAGE).
|
-
Nodarbība/Seminārs
|
Modalitāte
|
Norises vieta
|
Kontaktstundas
|
|---|---|---|
|
Klātiene
|
Auditorija
|
2
|
Tēmas
|
Praktiskajās nodarbībās iegūto rezultātu analīze. Ziņojumi par diagnostisko ģenētiskās testēšanas paraugu rezultātiem.
|
-
Lekcija
|
Modalitāte
|
Norises vieta
|
Kontaktstundas
|
|---|---|---|
|
Klātiene
|
Auditorija
|
2
|
Tēmas
|
DNS molekulas noslēpumi. Ģenētiskā polimorfisma pētījumi un to nozīme slimību etioloģijas izpratnē. Ģenētikas loma praktiskajā zobārstniecībā.
|
-
Nodarbība/Seminārs
|
Modalitāte
|
Norises vieta
|
Kontaktstundas
|
|---|---|---|
|
Klātiene
|
Auditorija
|
2
|
Tēmas
|
Mutes baktēriju uzsēšana DNS izdalīšanai. Paraugu izveide – kontroles grupa: DNS cilvēka (bez baktēriju piejaukuma). Baktēriju DNS pozitīvā un negatīvā kontrole. Reaģentu verifikācija. References laboratorijas.
|
-
Nodarbība/Seminārs
|
Modalitāte
|
Norises vieta
|
Kontaktstundas
|
|---|---|---|
|
Klātiene
|
Auditorija
|
2
|
Tēmas
|
Studentu portfolio prezentācijas.
|
-
Lekcija
|
Modalitāte
|
Norises vieta
|
Kontaktstundas
|
|---|---|---|
|
Klātiene
|
Mācību laboratorija
|
2
|
Tēmas
|
Periodontīta ģenētiskais aspekts.
|
-
Nodarbība/Seminārs
|
Modalitāte
|
Norises vieta
|
Kontaktstundas
|
|---|---|---|
|
Klātiene
|
Auditorija
|
2
|
Tēmas
|
Iegūto rezultātu validācija kā piemēra (parauga) metodi izmantojot sekvencēšanu.
|
-
Nodarbība/Seminārs
|
Modalitāte
|
Norises vieta
|
Kontaktstundas
|
|---|---|---|
|
Klātiene
|
Mācību laboratorija
|
2
|
Tēmas
|
DNS restrikcija un ligēšana.
|
-
Nodarbība/Seminārs
|
Modalitāte
|
Norises vieta
|
Kontaktstundas
|
|---|---|---|
|
Klātiene
|
Auditorija
|
2
|
Tēmas
|
Polimerāzes ķēdes reakcija (PĶR).
|
-
Nodarbība/Seminārs
|
Modalitāte
|
Norises vieta
|
Kontaktstundas
|
|---|---|---|
|
Klātiene
|
Mācību laboratorija
|
2
|
Tēmas
|
DNS analizēšanas programmas.
|
-
Nodarbība/Seminārs
|
Modalitāte
|
Norises vieta
|
Kontaktstundas
|
|---|---|---|
|
Klātiene
|
Auditorija
|
2
|
Tēmas
|
Rezultātu apspriešana. Darba par baktēriju identificēšanu apspriešana; darba nozīme (periodontīta molekulārā Dg).
|
-
Nodarbība/Seminārs
|
Modalitāte
|
Norises vieta
|
Kontaktstundas
|
|---|---|---|
|
Klātiene
|
Auditorija
|
2
|
Tēmas
|
DNS izdalīšanai nepieciešamo šķīdumu sagatavošana. DNS izdalīšana, izdalītas DNS kvalitātes noteikšana.
|
-
Nodarbība/Seminārs
|
Modalitāte
|
Norises vieta
|
Kontaktstundas
|
|---|---|---|
|
Klātiene
|
Auditorija
|
2
|
Tēmas
|
Iepazīšanas ar zinātniskās laboratorijas ierīcēm un darbu tajās. Individuāla eksperimenta plāna izstrāde. Pipetēšana.
|
-
Nodarbība/Seminārs
|
Modalitāte
|
Norises vieta
|
Kontaktstundas
|
|---|---|---|
|
Klātiene
|
Mācību laboratorija
|
2
|
Tēmas
|
DNS sekvencēšanas metodes.
|
-
Nodarbība/Seminārs
|
Modalitāte
|
Norises vieta
|
Kontaktstundas
|
|---|---|---|
|
Klātiene
|
Mācību laboratorija
|
2
|
Tēmas
|
Aktualitātes DNS pētniecībā.
|
Kopā kredītpunkti (ECTS):
3,00
Kontaktstundas:
32 ak. st.
Gala pārbaudījums:
Eksāmens (Rakstisks)
Bibliogrāfija
Obligātā literatūra
1.
Russell P.J. Genetics: A Molecular Approach. 3rd edition, Pearson, 2013.
2.
WS Klug, MR Cummings, ChA Spencer, MA Palladino, D Killian. Concepts of Genetics. Pearson, 12th ed., 2018.
Papildu literatūra
1.
Strachan T., Read A. Human Molecular Genetics. - GS, 2011
Citi informācijas avoti
1.
Internets. NCBI (DNA &RNA, Genetics&Medicine, Genes &Expression, Genomes&Maps). Papildus saites tiks norādītas studiju kursa apguves laikā.