Klīniskā citoģenētika I
Studiju kursa īstenotājs
Rezidentūras specialitāte
-
Par studiju kursu
Mērķis
Studiju rezultāti
Zināšanas
1.-Prasības citoģenētiski izmeklējamam materiālam (perifērās asinis, augļa asinis, amnija šķidrums, horija bārkstiņu bioptāts, ādas bioptāts) prenatālajā un postnatālajā ģenētiskajā diagnostikā. -Indikācijas citoģenētiskajiem izmeklējumiem prenatālajā un postnatālajā ģenētiskajā diagnostikā. -Īslaicīgās un ilglaicīgās šūnu kultūras. -Hromosomu preparātu pagatavošana no dažādiem audiem. -Hromosomu krāsošanas metodes (GTG, CBG, NOR). -Hromosomu aberāciju veidošanās iemesli, mehānismi, sastopamības biežums populācijā un nozīme cilvēka patoloģijā. Konstitucionālu (iedzimtu) hromosomu aberāciju veidi (hromosomu skaita un struktūras izmaiņas). -Biežāk sastopamo hromosomu aneiploīdiju sindromu etioloģija, klīniskās izpausmes un ģenētiskā konsultēšana. -Uniparentāla disomija un imprintings (veidošanās mehānismi, biežāk sastopamie sindromi). -Hromosomu normas varianti, fragilie saiti. -Starptautiskā Cilvēka citogenomikas nomenklatūra (ISCN). -Hromosomu nestabilitātes sindromi. -Teorētiskie un empīriskie atkārtošanās riska aprēķini dažādu hromosomu aberāciju gadījumā. -Prenatālo izmeklējumu īpatnības (mozaīcisma atrades interpretācija u.c.).
Prasmes
1.-Asins limfocītu, ādas fibroblastu, amnija šķidruma, horija bārkstiņu šūnu kultivēšana. -Hromosomu preparātu iegūšana (šūnu kultūru fiksēšana). -Hromosomu preparātu krāsošana (GTG, CBG, NOR). -Hromosomu mikroskopiskā analīze gaismas mikroskopā (hromosomu un to izmaiņu identificēšana mikroskopā). -Digitālo hromosomu analīzes programmu pielietošana kariotipēšanā. -Spēj aprakstīt konstatētās hromosomu izmaiņas saskaņā ar Starptautisko Cilvēka citogenomikas nomenklatūru (ISCN) prenatālajā un postnatālajā ģenētiskajā diagnostikā. -Atkārtošanās riska aprēķini dažādu hromosomomu aberāciju gadījumā.
Kompetences
1.-Mērķtiecīgi nozīmē citoģenētiskos testus un konsultē citu specialitāšu ārstus optimālāko citoģenētisko testu izvēlē atbilstoši klīniskajai situācijai prenatālajā un postnatālajā ģenētiskajā diagnostikā. -Konsultē veselības aprūpes speciālistus pareizai izmeklējamā materiāla savākšanai un nogādāšanai laboratorijā. -Veic kariotipa analīzi konstitucionālu (iedzimtu) hromosomu izmaiņu diagnostikā. -Interpretē kariotipa analīzes rezultātus saistībā ar klīnisko situāciju. -Spēj sniegt ģenētisko konsultāciju pacientam un viņa ģimenei iedzimtu hromosomu izmaiņu gadījumā.
Vērtēšana
Patstāvīgais darbs
|
Virsraksts
|
% no gala vērtējuma
|
Vērtējums
|
|---|---|---|
|
1.
Patstāvīgais darbs |
-
|
-
|
|
1. Izmantojot uz pierādījumiem balstītas elektorniskās datubāzes, meklēt ģenētisko variāciju fenotipisko un genotipsko korelāciju.
2. Izmantojot uz pierādījumiem balstītas zinātniskās literatūras datubāzes, izveidot individulaizētu slimības aprakstu pacientiem ar sindromālu - monogēnu, hromosomālu vai pārmantotu patoloģiju.
|
||
Pārbaudījums
|
Virsraksts
|
% no gala vērtējuma
|
Vērtējums
|
|---|---|---|
|
1.
Pārbaudījums |
-
|
-
|
|
Docētājs cikla beigās:
1. Novērtē medicīniskas ģenētikas rezidenta praktiskās iemaņas 10 baļļu sistēma, ierakstot vērtējumu rezidentu grāmatiņā.
2. Medicīniskas ģenētikas rezidenta teorētiskās zināšanas vērtē 10 baļļu sistēmā pec rakstiskā pārbaudījuma - daudzatbilžu tests, vērtējumu ierakstot rezidentu grāmatiņā.
|
||
Studiju kursa tēmu plāns
-
Seminārs
|
Modalitāte
|
Norises vieta
|
|
|---|---|---|
|
-
|
-
|
Tēmas
|
Darbs ar citoģenētisko izmeklējumu sistēmām; šūnu kultūru sēšana un audzēšana, hromosomu preparāta sagatavošana, hromosomu krāsošanas metodes, hromosomu identificēšana preparātā
|
-
Seminārs
|
Modalitāte
|
Norises vieta
|
|
|---|---|---|
|
-
|
-
|
Tēmas
|
Prenatālo citoģenētisko izmeklējumu indikācijas, metodes, rezultātu novērtēšana.
|
-
Seminārs
|
Modalitāte
|
Norises vieta
|
|
|---|---|---|
|
-
|
-
|
Tēmas
|
Invazīva diagnostika. Mātes šūnu kontaminācijas tests.
|
-
Seminārs
|
Modalitāte
|
Norises vieta
|
|
|---|---|---|
|
-
|
-
|
Tēmas
|
Horija bārkstiņu biopsijas un amniocentēzes apskate un salīdzinājums (priekšrocības un trūkumi).
|
-
Seminārs
|
Modalitāte
|
Norises vieta
|
|
|---|---|---|
|
-
|
-
|
Tēmas
|
Prenatālo citoģenētisko izmeklējumu indikācijas, metodes, rezultātu novērtēšana.
|
Bibliogrāfija
Obligātā literatūra
Gross, S. J. Introduction to Perinatal Disorders and Reproductive Genetics. In Emery and Rimoin’s Principles and Practice of Medical Genetics and Genomics, 2022
Milunsky, A., & Milunsky, J. M. Genetic Disorders and the Fetus: Diagnosis, Prevention and Treatment. 6th Edition, 2010
Leung, P. C. K., & Qiao, J. Human reproductive and prenatal genetics. In Human Reproductive and Prenatal Genetics, 2018
Harper, J. C. Preimplantation genetic diagnosis. In Preimplantation Genetic Diagnosis. 2nd Edition, 2009
DiMaio, M. S., Fox, J. E., & Mahoney, M. J. Prenatal Diagnosis: Cases and Clinical Challenges. In Prenatal Diagnosis: Cases and Clinical Challenges, 2010
Paladini, D., & Volpe, P. Ultrasound of Congenital Fetal Anomalies. In Ultrasound of Congenital Fetal Anomalies, 2018
Stevenson, R., Hall, J., Everman, D., & Solomon, B. (Eds.) Human Malformations and Related Anomalies. Oxford, UK: Oxford University Press, 2015
Harper, P. Practical Genetic Counselling. 7th Edition. CRC Press, 2011
Cassidy, S., Allanson, J. Management of Genetic Syndromes. Wiley-Blackwell, 2010
Firth, H., Hurst, J. Oxford Desk Reference Clinical Genetics. Oxford, 2007
Read, A, Donnai, D. New clinical Genetics. A guide to Genomics Medicine. Scion, 2021
Dhar, S., Sandesh, N, Eble, T. Hanbook of Clinical adult Genetics and genomics. Elssevier, 2020
Reardson, W. The Bedside Dysmorhologist. Oxford, 2016
Norton, M.E., Scoutt, L., Feldstein, V. Callens Ultrasonography in Obstretics And Gynecology. Elsevier, 2017
Hogge, A., Wilkins, I., Hills, L., Cohlan B. Sanders Structural Fetal Abnormalities. McGraw Hill Education, 2107
Hollak, C., Lachmann, R. Inherited Metabolic Disease in Adults.Oxford, 2016
Saudubray, F., Van den Berghe, W. Inbron Metabolic diseases. Springer, 2016
Katirji, B., Kaminski, J.H, Ruff, R.L. Neuromuscular Disorders in Clinical Practice. Vol1., Vol. 2., Springer, 2014
Govidan, R., Devarakonda, S. Cancer Genomics for the Clinician. Springer, 2019
Papildu literatūra
Jones, Kenneth L, Marilyn C. Jones, and Miguel. Campo. Smith's Recognizable Patterns of Human Malformation, 2013
Citi informācijas avoti
OMIM. https://omim.org
Genereviews. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK1116/
Phenomizer. HPO. https://hpo.jax.org/app/tools/phenomizer
Varsome. https://varsome.com/
Reprotox. https://www.reprotox.org/
Metagene. https://www.metagene.de/
Vademecum Metabolicum. http://www.vademetab.org/
Metabolic Emergency Protocol. https://www.emergencyprotocol.net/
Treat NMD. https://treat-nmd.org/
NCCN Guidelines. https://www.nccn.org/guidelines/guidelines-detail?category=2&id=1503