Veidlapa Nr. M-3 (8)
Studiju kursa apraksts
Molekulāri bioloģiskās izmeklēšanas metodes
Kursa kods
RKM_009
Zinātnes nozare
Klīniskā medicīna
Kredītpunkti (ECTS)
13,50
Mērķauditorija
Ārstniecība
LKI
8. līmenis
Studiju kursa īstenotājs
Kursa vadītājs
Aigars Reinis
Rezidentūras specialitāte
Specialitāte
Klīniskais mikrobiologs
Vadītājs
Aigars Reinis
Kontaktinformācija
-
Par studiju kursu
Mērķis
Dot zināšanas un praktiskās iemaņas par mikrobioloģijā pielietotām molekulāri bioloģiskajām izmeklēšanas metodēm.
Studiju rezultāti
Zināšanas
1.Aprakstīt dažādas nukleīnskābju noteikšanas tehnoloģijas un pēcamplifikācijas produktu detekciju un analīzi.
Prasmes
1.Veikt praktiski laboratorijās biežāk pielietotās molekulās bioloģijas metodes, analizēt rezultātus.
Kompetences
1.Sadarbībā ar klīnicistiem izvēlēties maksimāli efektīgāko molekulārbioloģisko metodi, diagnostiskā rezultāta sasniegšanai.
Vērtēšana
Patstāvīgais darbs
|
Virsraksts
|
% no gala vērtējuma
|
Vērtējums
|
|---|---|---|
|
1.
Patstāvīgais darbs |
-
|
-
|
|
Pastāvīgi un padziļināti apgūt molekulārbioloģisko metožu tehnoloģiju principus, sagatavot par tiem prezentācijas semināros.
|
||
Pārbaudījums
|
Virsraksts
|
% no gala vērtējuma
|
Vērtējums
|
|---|---|---|
|
1.
Pārbaudījums |
-
|
-
|
|
Dalība semināros un praktiskajos darbos, vērtēti 10 ballu sistēmā veido 50% gala vērtējuma, eksāmens – 50%.
|
||
Studiju kursa tēmu plāns
PILNA LAIKA
1. daļa
-
Seminārs
|
Modalitāte
|
Norises vieta
|
|
|---|---|---|
|
-
|
-
|
Tēmas
|
Pareiza materiāla un transporta barotnes izvēle, materiāla transportēšana un uzglabāšana.
|
-
Seminārs
|
Modalitāte
|
Norises vieta
|
|
|---|---|---|
|
-
|
-
|
Tēmas
|
Nukleīnskābju noteikšanas tehnoloģijas ar zondēm bez amplifikācijas (hibridizācija).
|
-
Seminārs
|
Modalitāte
|
Norises vieta
|
|
|---|---|---|
|
-
|
-
|
Tēmas
|
Nukleīnskābju noteikšanas tehnoloģijas ar amplifikāciju: Signāla amplifikācijas metodes (DNS/RNS hibrīda tveršana ar monoklonālām antivielām un fluorescentu signāla detekciju, Šķēlēja-Invader tehnoloģija (patentēta)).
|
-
Seminārs
|
Modalitāte
|
Norises vieta
|
|
|---|---|---|
|
-
|
-
|
Tēmas
|
Nukleīnskābju noteikšanas metodes ar amplifikāciju – mērķa nukleīnskābju amplifikācijas metodes: Polimerāzes ķēdes reakcija.
|
-
Seminārs
|
Modalitāte
|
Norises vieta
|
|
|---|---|---|
|
-
|
-
|
Tēmas
|
Reversās transkriptāzes polimerāzes ķēdes reakcija.
|
-
Seminārs
|
Modalitāte
|
Norises vieta
|
|
|---|---|---|
|
-
|
-
|
Tēmas
|
Ligzdotā polimerāzes ķēdes reakcija.
|
-
Seminārs
|
Modalitāte
|
Norises vieta
|
|
|---|---|---|
|
-
|
-
|
Tēmas
|
Divsoļu vai trīssoļu polimerāzes ķēdes reakcija ar mērķi mazināt nespecifisku produktu amplifikāciju.
|
-
Seminārs
|
Modalitāte
|
Norises vieta
|
|
|---|---|---|
|
-
|
-
|
Tēmas
|
Multiplex PĶR.
|
-
Seminārs
|
Modalitāte
|
Norises vieta
|
|
|---|---|---|
|
-
|
-
|
Tēmas
|
Polimerāzes ķēdes reakcija ar signāla detekciju reālajā laikā.
|
-
Seminārs
|
Modalitāte
|
Norises vieta
|
|
|---|---|---|
|
-
|
-
|
Tēmas
|
Uz transkripciju balstītās amplifikācijas metodes.
|
-
Seminārs
|
Modalitāte
|
Norises vieta
|
|
|---|---|---|
|
-
|
-
|
Tēmas
|
Izotermālās amplifikācijas metodes: Strand Displacement Amplification, Cilpas-mediēta amplifikācija, Helikāzes atkarīga amplifikācija.
|
-
Seminārs
|
Modalitāte
|
Norises vieta
|
|
|---|---|---|
|
-
|
-
|
Tēmas
|
Pēc amplifikācijas produktu detekcija un analīzes iespējas: Gēla elektroforēze, Kapilārā elektroforēze, Kolorimetriskā mikroplašu nolasīšanas sistēma, Sekvenēšana, Pavairotā materiāla uzsēdināšana uz mikrocelulozes, stripiem vai lodītēm un tā noteikšana, Masas spektrometrija.
|
Kopā kredītpunkti (ECTS):
13,50
Semināru skaits:
12
Ilgums (nedēļās):
12
Gala pārbaudījums:
Eksāmens rezidentūrā (Teorija un prakse)
Bibliogrāfija
Obligātā literatūra
1.
Clinical Microbiology Procedures Handbook. 4th Edition, 2016
2.
Laboratory Diagnosis. In: Levinson W., Chin-Hong P., Joyce E. A., Nussbaum J., Schwartz B. eds. Review of Medical Microbiology & Immunology: A Guide to Clinical Infectious Diseases. 16th Edition. McGraw-Hill; Accessed August 17, 2020.
3.
Principles of diagnostic medical microbiology. Eds. Riedel S., Hobden J.A., Miller S., et.al. Jawetz, Melnick, & Adelberg's Medical Microbiology, 28th Edition. McGraw-Hill, 2019.
4.
Manual of Molecular and Clinical Laboratory Immunology. 8th Edition, 2016
5.
Manual of Commercial Methods in Clinical Microbiology. John Wiley & Sons, Incorporated, 2016. ProQuest Ebook Central
6.
Molecular Medical Microbiology. edited by Andrew Sails, et al. Elsevier Science & Technology, 2014. ProQuest Ebook Central
Citi informācijas avoti
1.
ClinicalKey
2.
PubMed
3.
AccessMedicine
4.
ScienceDirect